La Fondation possède 19 sites internes où sont hébergés la grande majorité des expériences vivantes et conscientes. Petits en apparence, ces lieux sont en fait en grande partie souterrains.

La Fondation comprend plus d’une soixantaine d’unités externes localisées un peu partout dans le monde. Elles servent à faire le lien entre les différents endroits du globe et la Fondation en elle-même. Les expériences y sont stockées en attendant d’être transportées sur place. Ce sont des sites de liaison par lesquels transitent les informations. Ces lieux servent aussi de planques pour les espions en mauvaise posture, ou les témoins importants et en danger.

Le site hospitalier est un complexe à part, au cœur de la Fondation. Il est relié au bâtiment central par l'infirmerie générale où l'on va pour les petits bobos du quotidien mais également pour se faire indiquer le chemin dans ce dédale de services spécialisés tous plus différents les uns que les autres. Comme les accidents sont nombreux, on y retrouve un immense service des urgences qui peut accueillir une cinquantaine de personnes sans flancher. La technologie et l'outillage dernier cri sont au service des médecins 24 heures sur 24.

Le pénitencier est une unité très bien gardée. Comme son nom indique si bien sa fonction, il s'agit de l'endroit où sont regroupés, logés, nourris et blanchis les Class-D, en attendant leur collaboration pour les différents tests sur les SCP. La surveillance et les protocoles y sont très stricts. Aucun acte de violence entre gardes et prisonniers n'est toléré sauf lors d'évasion et les Class-D possèdent tout le nécessaire à leur confort.